DESeq2 · expression différentielle avec RNA-seq
Paquet R pour la normalisation, la dispersion et l’analyse différentielle des données de comptage RNA-seq.
Conditions d’utilisation
Fixer la version du paquet, la matrice de comptages, les métadonnées, les réplicats et le plan expérimental avant l’exécution.
Limites et contexte
Ne pas traiter automatiquement TPM/FPKM comme des comptages bruts ; ELUCENIA n’a exécuté ni le paquet ni sa vignette.
Fiche de source répertoriée. Mise en œuvre sur ELUCENIA et révision scientifique indépendante en attente.
Lien avec la recherche sur le cancer
Appui à la recherche — contexte nécessaire
Ressource pertinente pour le parcours de recherche ; son applicabilité dépend de l’étude, des données et de la méthode définies. Il n’y a pas d’intégration locale.
Applications : Génomique · Biomarqueurs