DESeq2 · expressão diferencial de RNA-seq
Pacote R para normalização, dispersão e análise diferencial de dados de contagem de RNA-seq.
Condições de uso
Fixar versão do pacote, matriz de contagens, metadados, replicatas e desenho experimental antes da execução.
Limites e contexto
Não tratar TPM/FPKM como contagens brutas automaticamente; pacote e vignette não executados pela ELUCENIA.
Ficha de fonte catalogada. Implementação na ELUCENIA e revisão científica independente pendentes.
Relação com a investigação do câncer
Apoio à investigação — requer contexto
Recurso pertinente ao percurso de investigação; aplicabilidade depende de estudo, dados e método definidos. Não há integração local.
Aplicações: Genômica · Biomarcadores