Definire l’unità di analisi
Distinguere persona, campione, tumore e momento. Più campioni della stessa persona non equivalgono a osservazioni indipendenti di persone diverse. Stabilire popolazione, selezione e variabili prima dei confronti.
Registrare versioni
Il Genomic Data Commons documenta elaborazione e riferimenti. Annotare versione dei dati, assemblaggio genomico, strumenti, parametri e filtri. Cambiare riferimento o annotazione può modificare risultati apparentemente relativi allo stesso esperimento.
Mantenere una traccia verificabile
Organizzare codice, dizionario e pulizia con versioni. Verificare trasformazioni e valori mancanti. Portali, annotazione e arricchimento aiutano a esplorare ipotesi; ripetibilità computazionale non significa causalità o utilità clinica.
Limiti interpretativi
Riproduzione tecnica e validazione biologica sono verifiche differenti.
I dati ad accesso controllato non vanno copiati o pubblicati senza autorizzazione adeguata.
Riferimenti originali
Prosegui la ricerca
Atlante del cancro
Domande di ricerca
Scegli gli strumenti in base a metodo, popolazione e obiettivo. Un collegamento tematico non ne convalida ogni uso.
Contenuti educativi per formulare e contestualizzare la ricerca. Consulta il documento originale, la popolazione studiata e la metodologia prima di interpretare una conclusione. Metodologia