pVACtools · recherche sur les néoantigènes
Ensemble de pipelines destinés à identifier, hiérarchiser et examiner les néoantigènes tumoraux dans le cadre de la recherche.
Conditions d’utilisation
Choisir le pipeline selon les données VCF, FASTA, de fusion ou d’épissage ; préciser le HLA, l’expression et les filtres en consignant leurs versions.
Limites et contexte
Un néoantigène prédit ne prouve ni sa présentation, ni son immunogénicité, ni le bénéfice d’un vaccin personnalisé. Les pipelines n’ont pas été exécutés.
Fiche de source répertoriée. Mise en œuvre sur ELUCENIA et révision scientifique indépendante en attente.
Lien avec la recherche sur le cancer
Appui à la recherche — contexte nécessaire
La documentation officielle distingue pVACseq, pVACbind, pVACfuse, pVACsplice et pVACview, qui répondent à des objectifs différents.
Applications : Immunologie · Génomique